Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gadd45gip1Q9CR59 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gadd45gip1Q9CR59 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gadd45gip1Q9CR59 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gadd45gip1Q9CR59 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms