Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9CQF4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9CQF4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9CQF4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9CQF4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9CQF4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9CQF4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9CQF4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CQF4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CQF4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CQF4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CQF4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CQF4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CQF4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CQF4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9CQF4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9CQF4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9CQF4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9CQF4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9CQF4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9CQF4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9CQF4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9CQF4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9CQF4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Q9CQF4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Q9CQF4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9CQF4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9CQF4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q9CQF4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9CQF4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9CQF4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9CQF4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9CQF4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9CQF4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9CQF4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms