Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpl39lQ9CQD0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl39lQ9CQD0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl39lQ9CQD0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms