Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gtf2a1Q99PM3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf2a1Q99PM3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf2a1Q99PM3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf2a1Q99PM3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf2a1Q99PM3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf2a1Q99PM3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf2a1Q99PM3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf2a1Q99PM3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf2a1Q99PM3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf2a1Q99PM3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf2a1Q99PM3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf2a1Q99PM3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2a1Q99PM3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2a1Q99PM3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf2a1Q99PM3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf2a1Q99PM3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf2a1Q99PM3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2a1Q99PM3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2a1Q99PM3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2a1Q99PM3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gtf2a1Q99PM3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gtf2a1Q99PM3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gtf2a1Q99PM3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2a1Q99PM3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2a1Q99PM3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2a1Q99PM3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gtf2a1Q99PM3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2a1Q99PM3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2a1Q99PM3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gtf2a1Q99PM3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gtf2a1Q99PM3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2a1Q99PM3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2a1Q99PM3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2a1Q99PM3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2a1Q99PM3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2a1Q99PM3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2a1Q99PM3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gtf2a1Q99PM3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gtf2a1Q99PM3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf2a1Q99PM3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gtf2a1Q99PM3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gtf2a1Q99PM3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtf2a1Q99PM3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtf2a1Q99PM3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gtf2a1Q99PM3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf2a1Q99PM3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf2a1Q99PM3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf2a1Q99PM3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gtf2a1Q99PM3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf2a1Q99PM3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gtf2a1Q99PM3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf2a1Q99PM3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf2a1Q99PM3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf2a1Q99PM3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gtf2a1Q99PM3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2a1Q99PM3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2a1Q99PM3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2a1Q99PM3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2a1Q99PM3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gtf2a1Q99PM3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf2a1Q99PM3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf2a1Q99PM3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gtf2a1Q99PM3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf2a1Q99PM3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf2a1Q99PM3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf2a1Q99PM3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf2a1Q99PM3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf2a1Q99PM3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf2a1Q99PM3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf2a1Q99PM3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gtf2a1Q99PM3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2a1Q99PM3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2a1Q99PM3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2a1Q99PM3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gtf2a1Q99PM3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gtf2a1Q99PM3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2a1Q99PM3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gtf2a1Q99PM3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Gtf2a1Q99PM3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2a1Q99PM3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2a1Q99PM3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2a1Q99PM3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2a1Q99PM3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gtf2a1Q99PM3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2a1Q99PM3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gtf2a1Q99PM3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2a1Q99PM3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2a1Q99PM3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2a1Q99PM3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2a1Q99PM3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gtf2a1Q99PM3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2a1Q99PM3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2a1Q99PM3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2a1Q99PM3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gtf2a1Q99PM3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gtf2a1Q99PM3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms