Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tlr3Q99MB1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tlr3Q99MB1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tlr3Q99MB1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tlr3Q99MB1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tlr3Q99MB1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tlr3Q99MB1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tlr3Q99MB1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tlr3Q99MB1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tlr3Q99MB1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tlr3Q99MB1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tlr3Q99MB1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Tlr3Q99MB1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tlr3Q99MB1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tlr3Q99MB1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tlr3Q99MB1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tlr3Q99MB1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tlr3Q99MB1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tlr3Q99MB1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tlr3Q99MB1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tlr3Q99MB1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tlr3Q99MB1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tlr3Q99MB1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tlr3Q99MB1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tlr3Q99MB1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tlr3Q99MB1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tlr3Q99MB1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tlr3Q99MB1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tlr3Q99MB1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tlr3Q99MB1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tlr3Q99MB1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tlr3Q99MB1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tlr3Q99MB1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tlr3Q99MB1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr3Q99MB1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr3Q99MB1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr3Q99MB1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr3Q99MB1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr3Q99MB1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tlr3Q99MB1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlr3Q99MB1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlr3Q99MB1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tlr3Q99MB1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tlr3Q99MB1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tlr3Q99MB1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tlr3Q99MB1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tlr3Q99MB1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tlr3Q99MB1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tlr3Q99MB1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms