Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clcc1Q99LI2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clcc1Q99LI2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clcc1Q99LI2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clcc1Q99LI2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms