Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC9

Pex6, Peroxisome assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex6Q99LC9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pex6Q99LC9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pex6Q99LC9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pex6Q99LC9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pex6Q99LC9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pex6Q99LC9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pex6Q99LC9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pex6Q99LC9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pex6Q99LC9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pex6Q99LC9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pex6Q99LC9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pex6Q99LC9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pex6Q99LC9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pex6Q99LC9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pex6Q99LC9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pex6Q99LC9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pex6Q99LC9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pex6Q99LC9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pex6Q99LC9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pex6Q99LC9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pex6Q99LC9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pex6Q99LC9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pex6Q99LC9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pex6Q99LC9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pex6Q99LC9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pex6Q99LC9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pex6Q99LC9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pex6Q99LC9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pex6Q99LC9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pex6Q99LC9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pex6Q99LC9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pex6Q99LC9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pex6Q99LC9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pex6Q99LC9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pex6Q99LC9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pex6Q99LC9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pex6Q99LC9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pex6Q99LC9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pex6Q99LC9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pex6Q99LC9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pex6Q99LC9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pex6Q99LC9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pex6Q99LC9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pex6Q99LC9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pex6Q99LC9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pex6Q99LC9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pex6Q99LC9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pex6Q99LC9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pex6Q99LC9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pex6Q99LC9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pex6Q99LC9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pex6Q99LC9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pex6Q99LC9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pex6Q99LC9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pex6Q99LC9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pex6Q99LC9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pex6Q99LC9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pex6Q99LC9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pex6Q99LC9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pex6Q99LC9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pex6Q99LC9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pex6Q99LC9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pex6Q99LC9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pex6Q99LC9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pex6Q99LC9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pex6Q99LC9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pex6Q99LC9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pex6Q99LC9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pex6Q99LC9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pex6Q99LC9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pex6Q99LC9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pex6Q99LC9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pex6Q99LC9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pex6Q99LC9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pex6Q99LC9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pex6Q99LC9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pex6Q99LC9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pex6Q99LC9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms