Protein–RNA interactions for Protein: Q99J25

Mrm1, rRNA methyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrm1Q99J25 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrm1Q99J25 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrm1Q99J25 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrm1Q99J25 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrm1Q99J25 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mrm1Q99J25 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrm1Q99J25 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrm1Q99J25 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms