Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Synpo2Q91YE8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Synpo2Q91YE8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Synpo2Q91YE8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Synpo2Q91YE8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Synpo2Q91YE8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Synpo2Q91YE8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Synpo2Q91YE8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Synpo2Q91YE8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Synpo2Q91YE8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Synpo2Q91YE8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Synpo2Q91YE8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Synpo2Q91YE8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Synpo2Q91YE8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Synpo2Q91YE8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Synpo2Q91YE8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Synpo2Q91YE8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Synpo2Q91YE8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Synpo2Q91YE8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Synpo2Q91YE8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Synpo2Q91YE8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Synpo2Q91YE8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Synpo2Q91YE8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Synpo2Q91YE8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms