Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc115Q8VE99 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc115Q8VE99 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc115Q8VE99 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc115Q8VE99 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc115Q8VE99 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc115Q8VE99 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc115Q8VE99 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc115Q8VE99 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc115Q8VE99 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc115Q8VE99 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc115Q8VE99 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc115Q8VE99 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc115Q8VE99 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc115Q8VE99 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc115Q8VE99 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc115Q8VE99 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc115Q8VE99 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc115Q8VE99 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc115Q8VE99 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc115Q8VE99 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc115Q8VE99 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc115Q8VE99 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc115Q8VE99 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms