Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
SnrkQ8VDU5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
SnrkQ8VDU5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
SnrkQ8VDU5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28,99■■■□□ 2,23
SnrkQ8VDU5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
SnrkQ8VDU5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
SnrkQ8VDU5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
SnrkQ8VDU5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
SnrkQ8VDU5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
SnrkQ8VDU5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28,97■■■□□ 2,23
SnrkQ8VDU5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28,97■■■□□ 2,23
SnrkQ8VDU5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
SnrkQ8VDU5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,95■■■□□ 2,23
SnrkQ8VDU5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28,95■■■□□ 2,22
SnrkQ8VDU5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
SnrkQ8VDU5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
SnrkQ8VDU5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
SnrkQ8VDU5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
SnrkQ8VDU5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
SnrkQ8VDU5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
SnrkQ8VDU5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
SnrkQ8VDU5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
SnrkQ8VDU5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28,93■■■□□ 2,22
SnrkQ8VDU5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
SnrkQ8VDU5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28,92■■■□□ 2,22
SnrkQ8VDU5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
SnrkQ8VDU5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
SnrkQ8VDU5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
SnrkQ8VDU5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
SnrkQ8VDU5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
SnrkQ8VDU5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
SnrkQ8VDU5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28,9■■■□□ 2,22
SnrkQ8VDU5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,89■■■□□ 2,22
SnrkQ8VDU5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
SnrkQ8VDU5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
SnrkQ8VDU5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
SnrkQ8VDU5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
SnrkQ8VDU5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
SnrkQ8VDU5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28,87■■■□□ 2,21
SnrkQ8VDU5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
SnrkQ8VDU5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
SnrkQ8VDU5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
SnrkQ8VDU5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28,85■■■□□ 2,21
SnrkQ8VDU5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
SnrkQ8VDU5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
SnrkQ8VDU5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
SnrkQ8VDU5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
SnrkQ8VDU5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,82■■■□□ 2,2
SnrkQ8VDU5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
SnrkQ8VDU5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
SnrkQ8VDU5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
SnrkQ8VDU5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28,81■■■□□ 2,2
SnrkQ8VDU5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
SnrkQ8VDU5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
SnrkQ8VDU5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28,78■■■□□ 2,2
SnrkQ8VDU5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
SnrkQ8VDU5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
SnrkQ8VDU5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
SnrkQ8VDU5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28,76■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28,76■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28,76■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28,75■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,73■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,73■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28,73■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28,72■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,19
SnrkQ8VDU5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28,7■■■□□ 2,18
SnrkQ8VDU5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
SnrkQ8VDU5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28,7■■■□□ 2,18
SnrkQ8VDU5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
SnrkQ8VDU5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28,69■■■□□ 2,18
SnrkQ8VDU5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28,69■■■□□ 2,18
SnrkQ8VDU5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
SnrkQ8VDU5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28,68■■■□□ 2,18
SnrkQ8VDU5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
SnrkQ8VDU5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28,68■■■□□ 2,18
SnrkQ8VDU5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28,68■■■□□ 2,18
SnrkQ8VDU5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
SnrkQ8VDU5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
SnrkQ8VDU5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
SnrkQ8VDU5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28,67■■■□□ 2,18
SnrkQ8VDU5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28,67■■■□□ 2,18
SnrkQ8VDU5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
SnrkQ8VDU5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,2 ms