Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d2Q8VD57 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d2Q8VD57 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d2Q8VD57 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d2Q8VD57 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d2Q8VD57 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d2Q8VD57 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d2Q8VD57 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sft2d2Q8VD57 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sft2d2Q8VD57 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sft2d2Q8VD57 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sft2d2Q8VD57 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sft2d2Q8VD57 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sft2d2Q8VD57 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sft2d2Q8VD57 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sft2d2Q8VD57 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms