Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnajc28Q8VCE1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnajc28Q8VCE1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnajc28Q8VCE1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnajc28Q8VCE1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnajc28Q8VCE1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnajc28Q8VCE1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnajc28Q8VCE1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnajc28Q8VCE1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnajc28Q8VCE1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnajc28Q8VCE1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnajc28Q8VCE1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnajc28Q8VCE1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnajc28Q8VCE1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnajc28Q8VCE1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dnajc28Q8VCE1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Dnajc28Q8VCE1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dnajc28Q8VCE1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dnajc28Q8VCE1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dnajc28Q8VCE1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dnajc28Q8VCE1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dnajc28Q8VCE1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dnajc28Q8VCE1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dnajc28Q8VCE1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dnajc28Q8VCE1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dnajc28Q8VCE1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dnajc28Q8VCE1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dnajc28Q8VCE1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dnajc28Q8VCE1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dnajc28Q8VCE1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnajc28Q8VCE1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dnajc28Q8VCE1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms