Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnaaf4Q8R368 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dnaaf4Q8R368 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Dnaaf4Q8R368 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Dnaaf4Q8R368 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Dnaaf4Q8R368 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Dnaaf4Q8R368 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Dnaaf4Q8R368 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Dnaaf4Q8R368 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dnaaf4Q8R368 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dnaaf4Q8R368 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Dnaaf4Q8R368 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dnaaf4Q8R368 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dnaaf4Q8R368 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dnaaf4Q8R368 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dnaaf4Q8R368 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dnaaf4Q8R368 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dnaaf4Q8R368 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Dnaaf4Q8R368 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dnaaf4Q8R368 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dnaaf4Q8R368 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dnaaf4Q8R368 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dnaaf4Q8R368 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dnaaf4Q8R368 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dnaaf4Q8R368 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnaaf4Q8R368 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Dnaaf4Q8R368 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Dnaaf4Q8R368 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Dnaaf4Q8R368 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms