Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hacd3Q8K2C9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hacd3Q8K2C9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hacd3Q8K2C9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hacd3Q8K2C9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hacd3Q8K2C9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hacd3Q8K2C9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hacd3Q8K2C9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hacd3Q8K2C9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hacd3Q8K2C9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hacd3Q8K2C9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hacd3Q8K2C9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hacd3Q8K2C9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hacd3Q8K2C9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hacd3Q8K2C9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hacd3Q8K2C9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hacd3Q8K2C9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hacd3Q8K2C9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hacd3Q8K2C9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hacd3Q8K2C9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hacd3Q8K2C9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hacd3Q8K2C9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hacd3Q8K2C9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hacd3Q8K2C9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms