Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem17Q8K0U3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem17Q8K0U3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem17Q8K0U3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem17Q8K0U3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem17Q8K0U3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem17Q8K0U3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem17Q8K0U3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem17Q8K0U3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem17Q8K0U3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem17Q8K0U3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem17Q8K0U3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem17Q8K0U3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem17Q8K0U3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem17Q8K0U3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem17Q8K0U3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem17Q8K0U3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem17Q8K0U3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem17Q8K0U3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem17Q8K0U3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem17Q8K0U3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem17Q8K0U3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem17Q8K0U3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms