Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scamp1Q8K021 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scamp1Q8K021 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scamp1Q8K021 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scamp1Q8K021 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scamp1Q8K021 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scamp1Q8K021 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scamp1Q8K021 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scamp1Q8K021 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Scamp1Q8K021 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scamp1Q8K021 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scamp1Q8K021 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scamp1Q8K021 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scamp1Q8K021 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scamp1Q8K021 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scamp1Q8K021 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp1Q8K021 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp1Q8K021 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scamp1Q8K021 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scamp1Q8K021 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scamp1Q8K021 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scamp1Q8K021 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Scamp1Q8K021 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms