Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Znf628Q8CJ78 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Znf628Q8CJ78 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Znf628Q8CJ78 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Znf628Q8CJ78 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf628Q8CJ78 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf628Q8CJ78 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf628Q8CJ78 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf628Q8CJ78 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Znf628Q8CJ78 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf628Q8CJ78 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Znf628Q8CJ78 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf628Q8CJ78 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf628Q8CJ78 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf628Q8CJ78 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf628Q8CJ78 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Znf628Q8CJ78 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf628Q8CJ78 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms