Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbxo43Q8CDI2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxo43Q8CDI2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxo43Q8CDI2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxo43Q8CDI2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxo43Q8CDI2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxo43Q8CDI2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxo43Q8CDI2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxo43Q8CDI2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxo43Q8CDI2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxo43Q8CDI2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxo43Q8CDI2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxo43Q8CDI2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbxo43Q8CDI2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbxo43Q8CDI2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbxo43Q8CDI2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbxo43Q8CDI2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbxo43Q8CDI2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fbxo43Q8CDI2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fbxo43Q8CDI2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fbxo43Q8CDI2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo43Q8CDI2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo43Q8CDI2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo43Q8CDI2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo43Q8CDI2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo43Q8CDI2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo43Q8CDI2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo43Q8CDI2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo43Q8CDI2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo43Q8CDI2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo43Q8CDI2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbxo43Q8CDI2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbxo43Q8CDI2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxo43Q8CDI2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxo43Q8CDI2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxo43Q8CDI2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxo43Q8CDI2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbxo43Q8CDI2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbxo43Q8CDI2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fbxo43Q8CDI2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fbxo43Q8CDI2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fbxo43Q8CDI2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fbxo43Q8CDI2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fbxo43Q8CDI2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fbxo43Q8CDI2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fbxo43Q8CDI2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fbxo43Q8CDI2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fbxo43Q8CDI2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fbxo43Q8CDI2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Fbxo43Q8CDI2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fbxo43Q8CDI2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fbxo43Q8CDI2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbxo43Q8CDI2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbxo43Q8CDI2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbxo43Q8CDI2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fbxo43Q8CDI2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fbxo43Q8CDI2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fbxo43Q8CDI2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fbxo43Q8CDI2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fbxo43Q8CDI2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fbxo43Q8CDI2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fbxo43Q8CDI2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fbxo43Q8CDI2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbxo43Q8CDI2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbxo43Q8CDI2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbxo43Q8CDI2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbxo43Q8CDI2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbxo43Q8CDI2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbxo43Q8CDI2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbxo43Q8CDI2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbxo43Q8CDI2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbxo43Q8CDI2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbxo43Q8CDI2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbxo43Q8CDI2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbxo43Q8CDI2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbxo43Q8CDI2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbxo43Q8CDI2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbxo43Q8CDI2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms