Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7I4

Apol9b, Apolipoprotein L 9b, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9bQ8C7I4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apol9bQ8C7I4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apol9bQ8C7I4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apol9bQ8C7I4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apol9bQ8C7I4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apol9bQ8C7I4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apol9bQ8C7I4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Apol9bQ8C7I4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apol9bQ8C7I4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apol9bQ8C7I4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apol9bQ8C7I4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apol9bQ8C7I4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol9bQ8C7I4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol9bQ8C7I4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol9bQ8C7I4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol9bQ8C7I4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apol9bQ8C7I4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apol9bQ8C7I4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apol9bQ8C7I4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apol9bQ8C7I4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apol9bQ8C7I4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apol9bQ8C7I4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apol9bQ8C7I4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apol9bQ8C7I4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apol9bQ8C7I4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Apol9bQ8C7I4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apol9bQ8C7I4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apol9bQ8C7I4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apol9bQ8C7I4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apol9bQ8C7I4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apol9bQ8C7I4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apol9bQ8C7I4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apol9bQ8C7I4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apol9bQ8C7I4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apol9bQ8C7I4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apol9bQ8C7I4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apol9bQ8C7I4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apol9bQ8C7I4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apol9bQ8C7I4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Apol9bQ8C7I4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apol9bQ8C7I4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apol9bQ8C7I4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apol9bQ8C7I4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apol9bQ8C7I4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apol9bQ8C7I4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apol9bQ8C7I4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apol9bQ8C7I4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apol9bQ8C7I4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apol9bQ8C7I4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apol9bQ8C7I4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apol9bQ8C7I4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apol9bQ8C7I4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apol9bQ8C7I4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apol9bQ8C7I4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apol9bQ8C7I4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apol9bQ8C7I4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apol9bQ8C7I4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apol9bQ8C7I4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apol9bQ8C7I4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apol9bQ8C7I4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apol9bQ8C7I4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apol9bQ8C7I4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apol9bQ8C7I4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apol9bQ8C7I4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Apol9bQ8C7I4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apol9bQ8C7I4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apol9bQ8C7I4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apol9bQ8C7I4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apol9bQ8C7I4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apol9bQ8C7I4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apol9bQ8C7I4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apol9bQ8C7I4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apol9bQ8C7I4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apol9bQ8C7I4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apol9bQ8C7I4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apol9bQ8C7I4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apol9bQ8C7I4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apol9bQ8C7I4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apol9bQ8C7I4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apol9bQ8C7I4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apol9bQ8C7I4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apol9bQ8C7I4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apol9bQ8C7I4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apol9bQ8C7I4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms