Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQR5

B430218F22Rik, RIKEN cDNA B430218F22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B430218F22RikQ8BQR5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B430218F22RikQ8BQR5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B430218F22RikQ8BQR5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B430218F22RikQ8BQR5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
B430218F22RikQ8BQR5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
B430218F22RikQ8BQR5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
B430218F22RikQ8BQR5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
B430218F22RikQ8BQR5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
B430218F22RikQ8BQR5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B430218F22RikQ8BQR5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B430218F22RikQ8BQR5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
B430218F22RikQ8BQR5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B430218F22RikQ8BQR5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B430218F22RikQ8BQR5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B430218F22RikQ8BQR5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B430218F22RikQ8BQR5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B430218F22RikQ8BQR5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B430218F22RikQ8BQR5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B430218F22RikQ8BQR5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B430218F22RikQ8BQR5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B430218F22RikQ8BQR5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B430218F22RikQ8BQR5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B430218F22RikQ8BQR5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B430218F22RikQ8BQR5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B430218F22RikQ8BQR5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B430218F22RikQ8BQR5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B430218F22RikQ8BQR5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
B430218F22RikQ8BQR5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
B430218F22RikQ8BQR5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
B430218F22RikQ8BQR5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B430218F22RikQ8BQR5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms