Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Gga3Q8BMI3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gga3Q8BMI3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gga3Q8BMI3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gga3Q8BMI3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gga3Q8BMI3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gga3Q8BMI3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gga3Q8BMI3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gga3Q8BMI3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gga3Q8BMI3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gga3Q8BMI3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gga3Q8BMI3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gga3Q8BMI3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gga3Q8BMI3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gga3Q8BMI3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gga3Q8BMI3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gga3Q8BMI3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gga3Q8BMI3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gga3Q8BMI3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Gga3Q8BMI3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gga3Q8BMI3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gga3Q8BMI3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gga3Q8BMI3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gga3Q8BMI3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gga3Q8BMI3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Gga3Q8BMI3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gga3Q8BMI3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gga3Q8BMI3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gga3Q8BMI3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gga3Q8BMI3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gga3Q8BMI3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gga3Q8BMI3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Gga3Q8BMI3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gga3Q8BMI3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gga3Q8BMI3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gga3Q8BMI3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gga3Q8BMI3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gga3Q8BMI3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gga3Q8BMI3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gga3Q8BMI3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gga3Q8BMI3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gga3Q8BMI3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gga3Q8BMI3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gga3Q8BMI3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms