Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmd3Q8BHD4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmd3Q8BHD4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmd3Q8BHD4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Frmd3Q8BHD4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Frmd3Q8BHD4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmd3Q8BHD4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Frmd3Q8BHD4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Frmd3Q8BHD4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Frmd3Q8BHD4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Frmd3Q8BHD4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Frmd3Q8BHD4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmd3Q8BHD4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmd3Q8BHD4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmd3Q8BHD4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmd3Q8BHD4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmd3Q8BHD4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmd3Q8BHD4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Frmd3Q8BHD4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Frmd3Q8BHD4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frmd3Q8BHD4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frmd3Q8BHD4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Frmd3Q8BHD4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frmd3Q8BHD4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frmd3Q8BHD4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frmd3Q8BHD4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frmd3Q8BHD4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frmd3Q8BHD4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frmd3Q8BHD4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frmd3Q8BHD4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frmd3Q8BHD4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frmd3Q8BHD4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frmd3Q8BHD4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmd3Q8BHD4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmd3Q8BHD4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmd3Q8BHD4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frmd3Q8BHD4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Frmd3Q8BHD4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Frmd3Q8BHD4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmd3Q8BHD4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmd3Q8BHD4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms