Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vipas39Q8BGQ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vipas39Q8BGQ1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vipas39Q8BGQ1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vipas39Q8BGQ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vipas39Q8BGQ1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vipas39Q8BGQ1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vipas39Q8BGQ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vipas39Q8BGQ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vipas39Q8BGQ1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vipas39Q8BGQ1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vipas39Q8BGQ1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vipas39Q8BGQ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vipas39Q8BGQ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vipas39Q8BGQ1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vipas39Q8BGQ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vipas39Q8BGQ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vipas39Q8BGQ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vipas39Q8BGQ1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vipas39Q8BGQ1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vipas39Q8BGQ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vipas39Q8BGQ1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vipas39Q8BGQ1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vipas39Q8BGQ1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vipas39Q8BGQ1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vipas39Q8BGQ1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vipas39Q8BGQ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vipas39Q8BGQ1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vipas39Q8BGQ1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vipas39Q8BGQ1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vipas39Q8BGQ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vipas39Q8BGQ1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vipas39Q8BGQ1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vipas39Q8BGQ1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vipas39Q8BGQ1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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