Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Liat1Q810M6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Liat1Q810M6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Liat1Q810M6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Liat1Q810M6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Liat1Q810M6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Liat1Q810M6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Liat1Q810M6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Liat1Q810M6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Liat1Q810M6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Liat1Q810M6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Liat1Q810M6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Liat1Q810M6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Liat1Q810M6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Liat1Q810M6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Liat1Q810M6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Liat1Q810M6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Liat1Q810M6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Liat1Q810M6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Liat1Q810M6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Liat1Q810M6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Liat1Q810M6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Liat1Q810M6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Liat1Q810M6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Liat1Q810M6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Liat1Q810M6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Liat1Q810M6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Liat1Q810M6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Liat1Q810M6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Liat1Q810M6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Liat1Q810M6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Liat1Q810M6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Liat1Q810M6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Liat1Q810M6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Liat1Q810M6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Liat1Q810M6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Liat1Q810M6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Liat1Q810M6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Liat1Q810M6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Liat1Q810M6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Liat1Q810M6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Liat1Q810M6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Liat1Q810M6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Liat1Q810M6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Liat1Q810M6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Liat1Q810M6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Liat1Q810M6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Liat1Q810M6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Liat1Q810M6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Liat1Q810M6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Liat1Q810M6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Liat1Q810M6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Liat1Q810M6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Liat1Q810M6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Liat1Q810M6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Liat1Q810M6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Liat1Q810M6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Liat1Q810M6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Liat1Q810M6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Liat1Q810M6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Liat1Q810M6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Liat1Q810M6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Liat1Q810M6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Liat1Q810M6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Liat1Q810M6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Liat1Q810M6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Liat1Q810M6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Liat1Q810M6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Liat1Q810M6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Liat1Q810M6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms