Protein–RNA interactions for Protein: Q80WG5

Lrrc8a, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8aQ80WG5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc8aQ80WG5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc8aQ80WG5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc8aQ80WG5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc8aQ80WG5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc8aQ80WG5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc8aQ80WG5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc8aQ80WG5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc8aQ80WG5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc8aQ80WG5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc8aQ80WG5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc8aQ80WG5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc8aQ80WG5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc8aQ80WG5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc8aQ80WG5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc8aQ80WG5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc8aQ80WG5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrrc8aQ80WG5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrrc8aQ80WG5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrrc8aQ80WG5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc8aQ80WG5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc8aQ80WG5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lrrc8aQ80WG5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc8aQ80WG5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc8aQ80WG5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc8aQ80WG5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc8aQ80WG5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc8aQ80WG5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc8aQ80WG5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc8aQ80WG5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms