Protein–RNA interactions for Protein: Q80TE0

Rpap1, RNA polymerase II-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap1Q80TE0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Rpap1Q80TE0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rpap1Q80TE0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rpap1Q80TE0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rpap1Q80TE0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Rpap1Q80TE0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rpap1Q80TE0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Rpap1Q80TE0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rpap1Q80TE0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rpap1Q80TE0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Rpap1Q80TE0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Rpap1Q80TE0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rpap1Q80TE0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rpap1Q80TE0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rpap1Q80TE0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Rpap1Q80TE0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rpap1Q80TE0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Rpap1Q80TE0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rpap1Q80TE0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rpap1Q80TE0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Rpap1Q80TE0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rpap1Q80TE0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rpap1Q80TE0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rpap1Q80TE0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rpap1Q80TE0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Rpap1Q80TE0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Rpap1Q80TE0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Rpap1Q80TE0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rpap1Q80TE0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Rpap1Q80TE0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Rpap1Q80TE0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Rpap1Q80TE0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Rpap1Q80TE0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rpap1Q80TE0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rpap1Q80TE0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rpap1Q80TE0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Rpap1Q80TE0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Rpap1Q80TE0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rpap1Q80TE0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Rpap1Q80TE0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.46
Rpap1Q80TE0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Rpap1Q80TE0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rpap1Q80TE0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rpap1Q80TE0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rpap1Q80TE0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rpap1Q80TE0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Rpap1Q80TE0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rpap1Q80TE0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Rpap1Q80TE0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rpap1Q80TE0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rpap1Q80TE0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rpap1Q80TE0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rpap1Q80TE0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rpap1Q80TE0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rpap1Q80TE0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rpap1Q80TE0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rpap1Q80TE0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Rpap1Q80TE0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Rpap1Q80TE0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rpap1Q80TE0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Rpap1Q80TE0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Rpap1Q80TE0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Rpap1Q80TE0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Rpap1Q80TE0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Rpap1Q80TE0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Rpap1Q80TE0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rpap1Q80TE0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rpap1Q80TE0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rpap1Q80TE0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rpap1Q80TE0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rpap1Q80TE0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rpap1Q80TE0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rpap1Q80TE0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rpap1Q80TE0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rpap1Q80TE0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rpap1Q80TE0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rpap1Q80TE0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rpap1Q80TE0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rpap1Q80TE0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rpap1Q80TE0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rpap1Q80TE0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Rpap1Q80TE0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Rpap1Q80TE0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Rpap1Q80TE0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Rpap1Q80TE0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rpap1Q80TE0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rpap1Q80TE0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rpap1Q80TE0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rpap1Q80TE0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rpap1Q80TE0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rpap1Q80TE0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rpap1Q80TE0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rpap1Q80TE0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rpap1Q80TE0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rpap1Q80TE0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rpap1Q80TE0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rpap1Q80TE0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Rpap1Q80TE0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rpap1Q80TE0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rpap1Q80TE0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms