Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smpd4Q6ZPR5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smpd4Q6ZPR5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smpd4Q6ZPR5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smpd4Q6ZPR5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smpd4Q6ZPR5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd4Q6ZPR5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd4Q6ZPR5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd4Q6ZPR5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smpd4Q6ZPR5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd4Q6ZPR5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd4Q6ZPR5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd4Q6ZPR5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd4Q6ZPR5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd4Q6ZPR5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd4Q6ZPR5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smpd4Q6ZPR5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smpd4Q6ZPR5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smpd4Q6ZPR5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpd4Q6ZPR5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpd4Q6ZPR5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpd4Q6ZPR5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpd4Q6ZPR5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smpd4Q6ZPR5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms