Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Timd4Q6U7R4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Timd4Q6U7R4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Timd4Q6U7R4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Timd4Q6U7R4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Timd4Q6U7R4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Timd4Q6U7R4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Timd4Q6U7R4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Timd4Q6U7R4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Timd4Q6U7R4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Timd4Q6U7R4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Timd4Q6U7R4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Timd4Q6U7R4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Timd4Q6U7R4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Timd4Q6U7R4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Timd4Q6U7R4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms