Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms