Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mfsd4aQ6PDC8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mfsd4aQ6PDC8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mfsd4aQ6PDC8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms