Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Arhgap20Q6IFT4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arhgap20Q6IFT4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arhgap20Q6IFT4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms