Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Smarca2Q6DIC0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Smarca2Q6DIC0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
Smarca2Q6DIC0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
Smarca2Q6DIC0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Smarca2Q6DIC0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Smarca2Q6DIC0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
Smarca2Q6DIC0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Smarca2Q6DIC0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Smarca2Q6DIC0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
Smarca2Q6DIC0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Smarca2Q6DIC0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
Smarca2Q6DIC0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Smarca2Q6DIC0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Smarca2Q6DIC0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Smarca2Q6DIC0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
Smarca2Q6DIC0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Smarca2Q6DIC0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
Smarca2Q6DIC0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Smarca2Q6DIC0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Smarca2Q6DIC0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC41.99■■■■■ 4.31
Smarca2Q6DIC0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
Smarca2Q6DIC0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Smarca2Q6DIC0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Smarca2Q6DIC0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Smarca2Q6DIC0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Smarca2Q6DIC0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Smarca2Q6DIC0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
Smarca2Q6DIC0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Smarca2Q6DIC0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Smarca2Q6DIC0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Smarca2Q6DIC0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Smarca2Q6DIC0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Smarca2Q6DIC0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Smarca2Q6DIC0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Smarca2Q6DIC0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Smarca2Q6DIC0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Smarca2Q6DIC0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Smarca2Q6DIC0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Smarca2Q6DIC0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
Smarca2Q6DIC0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Smarca2Q6DIC0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
Smarca2Q6DIC0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Smarca2Q6DIC0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Smarca2Q6DIC0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
Smarca2Q6DIC0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Smarca2Q6DIC0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
Smarca2Q6DIC0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Smarca2Q6DIC0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Smarca2Q6DIC0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Smarca2Q6DIC0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Smarca2Q6DIC0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Smarca2Q6DIC0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Smarca2Q6DIC0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
Smarca2Q6DIC0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Smarca2Q6DIC0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Smarca2Q6DIC0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Smarca2Q6DIC0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Smarca2Q6DIC0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
Smarca2Q6DIC0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Smarca2Q6DIC0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
Smarca2Q6DIC0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Smarca2Q6DIC0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
Smarca2Q6DIC0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Smarca2Q6DIC0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
Smarca2Q6DIC0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Smarca2Q6DIC0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
Smarca2Q6DIC0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Smarca2Q6DIC0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC41.71■■■■■ 4.27
Smarca2Q6DIC0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Smarca2Q6DIC0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Smarca2Q6DIC0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Smarca2Q6DIC0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Smarca2Q6DIC0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Smarca2Q6DIC0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Smarca2Q6DIC0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
Smarca2Q6DIC0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Smarca2Q6DIC0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
Smarca2Q6DIC0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Smarca2Q6DIC0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
Smarca2Q6DIC0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
Smarca2Q6DIC0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Smarca2Q6DIC0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC41.63■■■■■ 4.26
Smarca2Q6DIC0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Smarca2Q6DIC0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Smarca2Q6DIC0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Smarca2Q6DIC0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
Smarca2Q6DIC0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Smarca2Q6DIC0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Smarca2Q6DIC0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Smarca2Q6DIC0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Smarca2Q6DIC0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Smarca2Q6DIC0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Smarca2Q6DIC0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Smarca2Q6DIC0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Smarca2Q6DIC0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Smarca2Q6DIC0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Smarca2Q6DIC0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Smarca2Q6DIC0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
Smarca2Q6DIC0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms