Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp2a3Q64518 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp2a3Q64518 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp2a3Q64518 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2a3Q64518 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2a3Q64518 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp2a3Q64518 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2a3Q64518 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp2a3Q64518 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2a3Q64518 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2a3Q64518 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2a3Q64518 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2a3Q64518 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2a3Q64518 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2a3Q64518 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2a3Q64518 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2a3Q64518 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2a3Q64518 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2a3Q64518 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2a3Q64518 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2a3Q64518 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2a3Q64518 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2a3Q64518 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2a3Q64518 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2a3Q64518 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp2a3Q64518 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp2a3Q64518 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2a3Q64518 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms