Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sp4Q62445 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sp4Q62445 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sp4Q62445 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sp4Q62445 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sp4Q62445 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sp4Q62445 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sp4Q62445 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sp4Q62445 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sp4Q62445 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sp4Q62445 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sp4Q62445 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sp4Q62445 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sp4Q62445 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sp4Q62445 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sp4Q62445 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sp4Q62445 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Sp4Q62445 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Sp4Q62445 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Sp4Q62445 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sp4Q62445 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sp4Q62445 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sp4Q62445 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sp4Q62445 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sp4Q62445 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sp4Q62445 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sp4Q62445 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sp4Q62445 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sp4Q62445 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sp4Q62445 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sp4Q62445 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sp4Q62445 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sp4Q62445 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sp4Q62445 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sp4Q62445 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sp4Q62445 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sp4Q62445 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sp4Q62445 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sp4Q62445 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sp4Q62445 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sp4Q62445 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sp4Q62445 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Sp4Q62445 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sp4Q62445 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sp4Q62445 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sp4Q62445 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sp4Q62445 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sp4Q62445 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sp4Q62445 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sp4Q62445 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sp4Q62445 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sp4Q62445 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sp4Q62445 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms