Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SypQ62277 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SypQ62277 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SypQ62277 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SypQ62277 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SypQ62277 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SypQ62277 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SypQ62277 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SypQ62277 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SypQ62277 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SypQ62277 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SypQ62277 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SypQ62277 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SypQ62277 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SypQ62277 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SypQ62277 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SypQ62277 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SypQ62277 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SypQ62277 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SypQ62277 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SypQ62277 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SypQ62277 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SypQ62277 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SypQ62277 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SypQ62277 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SypQ62277 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SypQ62277 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SypQ62277 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SypQ62277 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SypQ62277 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SypQ62277 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SypQ62277 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SypQ62277 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SypQ62277 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SypQ62277 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SypQ62277 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SypQ62277 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SypQ62277 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SypQ62277 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SypQ62277 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SypQ62277 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SypQ62277 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SypQ62277 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SypQ62277 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SypQ62277 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SypQ62277 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SypQ62277 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SypQ62277 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SypQ62277 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SypQ62277 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SypQ62277 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SypQ62277 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SypQ62277 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SypQ62277 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SypQ62277 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SypQ62277 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SypQ62277 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SypQ62277 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SypQ62277 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SypQ62277 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SypQ62277 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SypQ62277 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SypQ62277 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SypQ62277 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SypQ62277 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SypQ62277 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SypQ62277 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SypQ62277 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SypQ62277 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SypQ62277 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SypQ62277 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SypQ62277 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SypQ62277 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SypQ62277 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SypQ62277 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SypQ62277 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SypQ62277 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SypQ62277 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SypQ62277 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SypQ62277 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SypQ62277 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SypQ62277 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SypQ62277 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SypQ62277 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SypQ62277 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SypQ62277 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SypQ62277 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SypQ62277 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SypQ62277 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SypQ62277 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SypQ62277 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SypQ62277 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SypQ62277 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SypQ62277 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SypQ62277 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SypQ62277 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SypQ62277 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SypQ62277 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SypQ62277 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SypQ62277 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms