Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC21,97■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC21,97■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21,96■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC21,96■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,96■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21,96■■□□□ 1,11
Prm3Q62100 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21,95■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC21,95■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC21,94■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21,93■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,91■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC21,91■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC21,9■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21,9■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21,9■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,1
Prm3Q62100 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,89■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,89■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC21,88■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21,87■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21,86■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21,85■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,85■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,84■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,84■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,83■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Prm3Q62100 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,83■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21,82■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21,82■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21,81■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC21,8■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,79■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC21,79■■□□□ 1,08
Prm3Q62100 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
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