Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EsrrbQ61539 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EsrrbQ61539 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EsrrbQ61539 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EsrrbQ61539 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms