Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dsg1aQ61495 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dsg1aQ61495 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dsg1aQ61495 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dsg1aQ61495 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dsg1aQ61495 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dsg1aQ61495 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dsg1aQ61495 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dsg1aQ61495 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dsg1aQ61495 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dsg1aQ61495 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dsg1aQ61495 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Dsg1aQ61495 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dsg1aQ61495 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Dsg1aQ61495 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dsg1aQ61495 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dsg1aQ61495 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Dsg1aQ61495 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dsg1aQ61495 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dsg1aQ61495 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dsg1aQ61495 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dsg1aQ61495 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Dsg1aQ61495 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dsg1aQ61495 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dsg1aQ61495 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dsg1aQ61495 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms