Protein–RNA interactions for Protein: Q5YIR8

Clec4a4, C-type lectin domain family 4, member a4, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a4Q5YIR8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec4a4Q5YIR8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clec4a4Q5YIR8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec4a4Q5YIR8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec4a4Q5YIR8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clec4a4Q5YIR8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clec4a4Q5YIR8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4a4Q5YIR8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4a4Q5YIR8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4a4Q5YIR8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4a4Q5YIR8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4a4Q5YIR8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4a4Q5YIR8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4a4Q5YIR8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4a4Q5YIR8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4a4Q5YIR8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec4a4Q5YIR8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec4a4Q5YIR8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec4a4Q5YIR8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec4a4Q5YIR8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4a4Q5YIR8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4a4Q5YIR8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4a4Q5YIR8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4a4Q5YIR8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clec4a4Q5YIR8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec4a4Q5YIR8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec4a4Q5YIR8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec4a4Q5YIR8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec4a4Q5YIR8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clec4a4Q5YIR8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec4a4Q5YIR8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec4a4Q5YIR8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec4a4Q5YIR8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec4a4Q5YIR8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec4a4Q5YIR8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clec4a4Q5YIR8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clec4a4Q5YIR8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clec4a4Q5YIR8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clec4a4Q5YIR8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec4a4Q5YIR8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec4a4Q5YIR8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec4a4Q5YIR8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clec4a4Q5YIR8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec4a4Q5YIR8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms