Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
9930111J21Rik1Q5SVP0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms