Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PfasQ5SUR0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PfasQ5SUR0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PfasQ5SUR0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PfasQ5SUR0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PfasQ5SUR0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PfasQ5SUR0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PfasQ5SUR0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PfasQ5SUR0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PfasQ5SUR0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PfasQ5SUR0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PfasQ5SUR0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PfasQ5SUR0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PfasQ5SUR0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PfasQ5SUR0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.8
PfasQ5SUR0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PfasQ5SUR0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PfasQ5SUR0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PfasQ5SUR0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PfasQ5SUR0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PfasQ5SUR0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PfasQ5SUR0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PfasQ5SUR0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PfasQ5SUR0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PfasQ5SUR0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PfasQ5SUR0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PfasQ5SUR0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms