Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctc1Q5SUQ9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctc1Q5SUQ9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctc1Q5SUQ9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctc1Q5SUQ9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctc1Q5SUQ9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctc1Q5SUQ9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctc1Q5SUQ9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctc1Q5SUQ9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ctc1Q5SUQ9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctc1Q5SUQ9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctc1Q5SUQ9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctc1Q5SUQ9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctc1Q5SUQ9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctc1Q5SUQ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctc1Q5SUQ9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctc1Q5SUQ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctc1Q5SUQ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctc1Q5SUQ9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctc1Q5SUQ9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctc1Q5SUQ9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctc1Q5SUQ9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctc1Q5SUQ9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctc1Q5SUQ9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctc1Q5SUQ9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctc1Q5SUQ9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctc1Q5SUQ9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctc1Q5SUQ9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctc1Q5SUQ9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctc1Q5SUQ9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctc1Q5SUQ9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctc1Q5SUQ9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctc1Q5SUQ9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctc1Q5SUQ9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctc1Q5SUQ9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctc1Q5SUQ9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctc1Q5SUQ9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctc1Q5SUQ9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctc1Q5SUQ9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctc1Q5SUQ9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms