Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf215Q5SPX3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf215Q5SPX3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf215Q5SPX3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf215Q5SPX3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf215Q5SPX3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf215Q5SPX3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf215Q5SPX3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf215Q5SPX3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf215Q5SPX3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf215Q5SPX3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf215Q5SPX3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf215Q5SPX3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf215Q5SPX3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf215Q5SPX3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf215Q5SPX3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf215Q5SPX3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms