Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp13Q5BKP2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp13Q5BKP2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp13Q5BKP2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp13Q5BKP2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp13Q5BKP2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp13Q5BKP2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp13Q5BKP2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp13Q5BKP2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp13Q5BKP2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp13Q5BKP2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp13Q5BKP2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp13Q5BKP2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp13Q5BKP2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp13Q5BKP2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp13Q5BKP2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp13Q5BKP2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp13Q5BKP2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp13Q5BKP2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp13Q5BKP2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp13Q5BKP2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp13Q5BKP2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp13Q5BKP2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp13Q5BKP2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp13Q5BKP2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp13Q5BKP2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp13Q5BKP2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp13Q5BKP2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp13Q5BKP2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp13Q5BKP2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp13Q5BKP2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp13Q5BKP2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp13Q5BKP2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp13Q5BKP2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp13Q5BKP2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp13Q5BKP2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp13Q5BKP2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp13Q5BKP2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp13Q5BKP2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp13Q5BKP2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp13Q5BKP2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp13Q5BKP2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp13Q5BKP2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp13Q5BKP2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp13Q5BKP2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp13Q5BKP2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp13Q5BKP2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp13Q5BKP2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp13Q5BKP2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp13Q5BKP2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp13Q5BKP2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp13Q5BKP2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp13Q5BKP2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp13Q5BKP2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp13Q5BKP2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp13Q5BKP2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp13Q5BKP2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp13Q5BKP2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp13Q5BKP2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp13Q5BKP2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp13Q5BKP2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp13Q5BKP2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp13Q5BKP2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp13Q5BKP2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp13Q5BKP2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp13Q5BKP2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp13Q5BKP2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp13Q5BKP2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp13Q5BKP2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp13Q5BKP2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp13Q5BKP2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp13Q5BKP2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp13Q5BKP2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp13Q5BKP2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp13Q5BKP2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp13Q5BKP2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp13Q5BKP2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp13Q5BKP2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp13Q5BKP2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp13Q5BKP2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp13Q5BKP2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp13Q5BKP2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp13Q5BKP2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp13Q5BKP2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp13Q5BKP2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp13Q5BKP2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp13Q5BKP2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp13Q5BKP2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp13Q5BKP2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp13Q5BKP2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp13Q5BKP2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp13Q5BKP2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp13Q5BKP2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp13Q5BKP2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp13Q5BKP2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp13Q5BKP2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp13Q5BKP2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp13Q5BKP2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp13Q5BKP2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp13Q5BKP2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms