Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Srbd1Q497V5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srbd1Q497V5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Srbd1Q497V5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Srbd1Q497V5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srbd1Q497V5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srbd1Q497V5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srbd1Q497V5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srbd1Q497V5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Srbd1Q497V5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srbd1Q497V5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srbd1Q497V5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srbd1Q497V5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srbd1Q497V5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srbd1Q497V5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srbd1Q497V5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srbd1Q497V5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Srbd1Q497V5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Srbd1Q497V5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Srbd1Q497V5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Srbd1Q497V5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Srbd1Q497V5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Srbd1Q497V5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Srbd1Q497V5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.5 ms