Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp48Q3V0C5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Usp48Q3V0C5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Usp48Q3V0C5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp48Q3V0C5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp48Q3V0C5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp48Q3V0C5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp48Q3V0C5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp48Q3V0C5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp48Q3V0C5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp48Q3V0C5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp48Q3V0C5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp48Q3V0C5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp48Q3V0C5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp48Q3V0C5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp48Q3V0C5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp48Q3V0C5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp48Q3V0C5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp48Q3V0C5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp48Q3V0C5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp48Q3V0C5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp48Q3V0C5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp48Q3V0C5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp48Q3V0C5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp48Q3V0C5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp48Q3V0C5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp48Q3V0C5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp48Q3V0C5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp48Q3V0C5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp48Q3V0C5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp48Q3V0C5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp48Q3V0C5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp48Q3V0C5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp48Q3V0C5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp48Q3V0C5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp48Q3V0C5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp48Q3V0C5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp48Q3V0C5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp48Q3V0C5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp48Q3V0C5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp48Q3V0C5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp48Q3V0C5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp48Q3V0C5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp48Q3V0C5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp48Q3V0C5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp48Q3V0C5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Usp48Q3V0C5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp48Q3V0C5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp48Q3V0C5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp48Q3V0C5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp48Q3V0C5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp48Q3V0C5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp48Q3V0C5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp48Q3V0C5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp48Q3V0C5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp48Q3V0C5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp48Q3V0C5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp48Q3V0C5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp48Q3V0C5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp48Q3V0C5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp48Q3V0C5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp48Q3V0C5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp48Q3V0C5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp48Q3V0C5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp48Q3V0C5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp48Q3V0C5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp48Q3V0C5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp48Q3V0C5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp48Q3V0C5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp48Q3V0C5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp48Q3V0C5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp48Q3V0C5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp48Q3V0C5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp48Q3V0C5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp48Q3V0C5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp48Q3V0C5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp48Q3V0C5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp48Q3V0C5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp48Q3V0C5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp48Q3V0C5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp48Q3V0C5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp48Q3V0C5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp48Q3V0C5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Usp48Q3V0C5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp48Q3V0C5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp48Q3V0C5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp48Q3V0C5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp48Q3V0C5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp48Q3V0C5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp48Q3V0C5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp48Q3V0C5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp48Q3V0C5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp48Q3V0C5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp48Q3V0C5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp48Q3V0C5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp48Q3V0C5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp48Q3V0C5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp48Q3V0C5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp48Q3V0C5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp48Q3V0C5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms