Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYK3

Tbc1d9, TBC1 domain family member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9Q3UYK3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tbc1d9Q3UYK3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tbc1d9Q3UYK3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tbc1d9Q3UYK3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tbc1d9Q3UYK3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tbc1d9Q3UYK3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tbc1d9Q3UYK3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tbc1d9Q3UYK3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tbc1d9Q3UYK3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tbc1d9Q3UYK3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tbc1d9Q3UYK3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tbc1d9Q3UYK3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tbc1d9Q3UYK3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tbc1d9Q3UYK3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tbc1d9Q3UYK3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tbc1d9Q3UYK3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tbc1d9Q3UYK3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Tbc1d9Q3UYK3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tbc1d9Q3UYK3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tbc1d9Q3UYK3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Tbc1d9Q3UYK3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tbc1d9Q3UYK3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tbc1d9Q3UYK3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tbc1d9Q3UYK3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tbc1d9Q3UYK3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tbc1d9Q3UYK3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tbc1d9Q3UYK3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tbc1d9Q3UYK3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tbc1d9Q3UYK3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tbc1d9Q3UYK3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tbc1d9Q3UYK3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tbc1d9Q3UYK3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tbc1d9Q3UYK3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tbc1d9Q3UYK3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tbc1d9Q3UYK3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tbc1d9Q3UYK3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tbc1d9Q3UYK3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tbc1d9Q3UYK3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tbc1d9Q3UYK3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tbc1d9Q3UYK3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tbc1d9Q3UYK3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tbc1d9Q3UYK3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Tbc1d9Q3UYK3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tbc1d9Q3UYK3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tbc1d9Q3UYK3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tbc1d9Q3UYK3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tbc1d9Q3UYK3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tbc1d9Q3UYK3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tbc1d9Q3UYK3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tbc1d9Q3UYK3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tbc1d9Q3UYK3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tbc1d9Q3UYK3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tbc1d9Q3UYK3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tbc1d9Q3UYK3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tbc1d9Q3UYK3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tbc1d9Q3UYK3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tbc1d9Q3UYK3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tbc1d9Q3UYK3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Tbc1d9Q3UYK3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tbc1d9Q3UYK3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tbc1d9Q3UYK3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Tbc1d9Q3UYK3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tbc1d9Q3UYK3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tbc1d9Q3UYK3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Tbc1d9Q3UYK3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tbc1d9Q3UYK3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tbc1d9Q3UYK3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tbc1d9Q3UYK3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tbc1d9Q3UYK3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tbc1d9Q3UYK3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tbc1d9Q3UYK3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tbc1d9Q3UYK3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tbc1d9Q3UYK3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tbc1d9Q3UYK3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tbc1d9Q3UYK3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tbc1d9Q3UYK3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tbc1d9Q3UYK3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tbc1d9Q3UYK3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tbc1d9Q3UYK3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tbc1d9Q3UYK3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tbc1d9Q3UYK3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tbc1d9Q3UYK3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Tbc1d9Q3UYK3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tbc1d9Q3UYK3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tbc1d9Q3UYK3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tbc1d9Q3UYK3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tbc1d9Q3UYK3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tbc1d9Q3UYK3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tbc1d9Q3UYK3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tbc1d9Q3UYK3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tbc1d9Q3UYK3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tbc1d9Q3UYK3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tbc1d9Q3UYK3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tbc1d9Q3UYK3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tbc1d9Q3UYK3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tbc1d9Q3UYK3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tbc1d9Q3UYK3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tbc1d9Q3UYK3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tbc1d9Q3UYK3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tbc1d9Q3UYK3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms