Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Arfgef3Q3UGY8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Arfgef3Q3UGY8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arfgef3Q3UGY8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arfgef3Q3UGY8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfgef3Q3UGY8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfgef3Q3UGY8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfgef3Q3UGY8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfgef3Q3UGY8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfgef3Q3UGY8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arfgef3Q3UGY8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arfgef3Q3UGY8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfgef3Q3UGY8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arfgef3Q3UGY8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfgef3Q3UGY8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfgef3Q3UGY8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfgef3Q3UGY8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfgef3Q3UGY8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Arfgef3Q3UGY8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfgef3Q3UGY8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arfgef3Q3UGY8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Arfgef3Q3UGY8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef3Q3UGY8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms