Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Shcbp1lQ3TTP0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shcbp1lQ3TTP0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shcbp1lQ3TTP0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Shcbp1lQ3TTP0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.3 ms