Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc102aQ3TMW1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc102aQ3TMW1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc102aQ3TMW1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc102aQ3TMW1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 345.5 ms